本实用新型提供了一种电机轴装配结构及空调器，电机轴装配结构包括支撑轴套和用于设置在风叶电机上的电机短轴，电机短轴呈棱柱结构，棱柱结构具有多个弧形侧面和多个平直侧面，弧形侧面与平直侧面相邻设置，且不同的弧形侧面间隔设置、不同的平直侧面间隔设置，支撑轴套上设有与电机短轴相适配的插接槽；在装配状态下，电机短轴用于插设于插接槽内。本实用新型的电机轴装配结构通过在电机短轴上设置多个弧形侧面和多个平直侧面，并将弧形侧面和平直侧面相邻设置，可以增大电机短轴的受力面积，从而增大电机短轴传递给贯流风叶的驱动力，让贯流风叶能够更好地克服旋转过程中受到的阻力，使得贯流风叶转动更为顺畅，从而提高了空调器的运行效果。