本实用新型提供一种跨境生物制品综合检疫处理设备，包括综合处理模块和分类输送模块，综合处理模块包括同时具备熏蒸功能、高温高压处理功能的熏蒸高温高压集成处理机构和用于对生物制品进行焚烧处理的焚烧处理机构，分类输送模块包括输送机构和用于将生物制品导向相应处理机构的拨板，拨板由拨板驱动机构驱动。本实用新型将熏蒸设备和高温高压处理设备以及焚烧设备进行了集成，与现有的大型处理设备相比体积小巧、功能丰富，使之能够设置在出入境检验检疫现场的建筑物内，专门用于出入境检疫中的生物制品处理，这种方式提高了处理的及时性，避免了运输中发生意外导致存在安全威胁的生物制品入境的情况，降低了安全隐患。