本实用新型公开了一种用于河道治理的生物处理系统，包括两个空气管，两个空气管之间均匀的设有若干填料机构，两个空气管之间还均匀的设有若干曝气膜组件，所述曝气膜组件与填料机构之间是相互交错分布，所述空气管的进气端贯通连接有鼓风机；通过鼓风机向空气管内鼓送空气，并通过空气管送至曝气膜组件，最后通过曝气膜组件进入河水内，大量的空气进入河水中可以增加河水中的氧气，打破水体分层，使水体底泥界面的厌氧环境变为好氧环境，增强微生物繁殖生化效果，从而促进河道内微生物新陈代谢，利用微生物“吃掉”有机物，使之转化为二氧化碳、水和简单的无机物，从而提升河道本身的“消化”污物的能力，利用河道内部自身的微生物净化河水。