本实用新型提供了一种自动化菌棒加工装置，包括圆盘型底座，设置在底座外沿的环形循环传送带，所述环形循环传送带中等间距竖直安装有若干个放置管，所述放置管的直径与所加工的菌棒直径相配合，所述底座上方对应环形循环传送带的位置还分别设置有进料机构和封口机构，且进料机构和封口机构分别对应放置管的顶部设置，所述放置管底部为可开关式结构；本实用新型利用环形循环传送带来移动菌棒并且通过进料机构和封口机构进行流水式加工，可以极大的提高菌棒的生产效率，并且该生产过程中仅需要人工放入塑料袋这一简单操作，相比以前单人手工填料封装的方式，也降低了人力消耗，节约了成本，同时还降低了单人的劳动量，更为人性化。