本实用新型公开了一种智能充电的电动牙刷消毒器，包括收纳座、盖体及无线充电发射单元，其中，收纳座具有容纳电动牙刷的收容腔，收容腔具有可供电动牙刷装入的开口；盖体枢接至收纳座并在打开开口的打开位置和关闭开口的关闭位置之间可枢转；无线充电发射单元设在盖体内，当盖体位于关闭位置时，盖体与电动牙刷的手柄邻近，以使盖体内的无线充电发射单元能够向电动牙刷的手柄内的无线充电接收单元传输电能。根据本实用新型实施例提供的智能充电的电动牙刷消毒器，具有无线充电功能，在对电动牙刷消毒的同时，可以为电动牙刷充电，使用非常方便，并且，可以降低用户成本。