本实用新型提供了一种用于水样微生物项目检测的抽滤装置，包括用于与真空泵的抽气管路连接的抽滤箱、多个滤芯以及位于抽滤箱的上方的滤水箱；其中，抽滤箱的顶壁设有多个安装孔；多个滤芯与多个安装孔一一对应密封连接，每个滤芯的口部均设有承接腔；承接腔的下方设有用于抽滤不同种类的微生物的过滤组件；滤水箱设有多个独立的容水腔，多个容水腔与多个安装孔一一对应设置，每个容水腔的底部均设有出水接头，出水接头对应插装于承接腔内，出水接头与承接腔的腔壁之间设有第一密封圈。本实用新型提供的一种用于水样微生物项目检测的抽滤装置清洁灭菌方便，针对同一水样能够同时检测多种微生物项目，检测效率高。