本实用新型公开了一种能量差驱动共轭泵系统，设有高能态介质输出端和低能态介质输入端，高能态介质输出端与能量存储装置连接，低能态介质输入端与一低能态输入装置连接，往复机构分别与能量存储装置、能量差生成装置形成驱动连接，能量差生成装置包括一缸体，其内活塞将缸体内空间分隔为第一腔室和第二腔室，第一腔室和第二腔室内设有工作介质；第一腔室通过第一管路和第二管路分别与第一能量交换装置连接、第二能量交换装置连接，第一能量交换装置和第二能量交换装置分别与多能量产出装置连接。在驱动能量差生成装置中的活塞运动过程中，会在第一腔室和第二腔室内分别形成交替的可供利用的高压和低压，且往复机构大大提高了能量转换的效率。