本实用新型涉及环保水处理技术领域，且公开了一种水处理微生物菌种活化及小试应用双功能自动化设备。该水处理微生物菌种活化及小试应用双功能自动化设备，包括活化装置和小试装置，所述活化装置的右侧固定安装有小试装置，所述活化装置包括装置底座。该水处理微生物菌种活化及小试应用双功能自动化设备，将菌粉从入料口加入到活化箱内部，对菌种进行活化，活化完成后，启动第二水泵抽取适量污水到小试箱内部，启动第一水泵从活化箱内抽取适量菌液到小试箱内部，启动第三电机，带动小试搅拌杆转动，加速菌液与污水的混合，启动曝气机，提高混合溶液的氧气含量，进行菌种的小试，使菌种的活化和小试在同一设备中进行，提高了设备的利用率。