本发明公开了一种节流器电气控制系统及控制方法，所述控制系统包括：压力检测单元：连接信号调理单元，采集并发送井下压力波信号；温度检测单元：采用温度传感器，用于采集井下温度信息；电机模块：包括电机驱动单元、电机编码单元和电机系统，所述电机驱动单元与电机编码单元分别向电机系统发送驱动信号与编码信号，控制电机的转速；中央控制单元：通过IO接口与模数转换器相连，接收模数转换器传递的压力波信号，唤醒中央控制器并生成解码命令，通过解码命令唤醒电机和温度传感器，执行节流器阀门控制操作。远程控制中心，与中央控制单元通过无线模块相连，控制系统的工作模式和进行温度补偿。本发明结构简单，方便安装和维护，能够方便地控制节流器工作。