本发明提供了一种与鸡腿部皮肤毛囊密度性状相关的SNP分子标记及其检测方法与应用，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，且SEQ ID NO:1的第500位为A或C。本发明提供了一种与鸡腿部皮肤毛囊密度性状相关的SNP分子标记，可以用于家系选育中的早期选择，也可在选配中提供分子依据。本发明的SNP分子标记为鸡腿部皮肤毛囊密度性状的筛选提供了新的方法，可以节省生产成本并加快遗传发展，更好地服务于优质肉鸡的育种，具有很大的经济价值和科研价值。