本发明涉及一种人工智能技术，揭露了一种智能化药物毒性判断方法，包括：接收包括分子结构序列的药物数据集与标签集，并基于霍夫曼编码技术对所述分子结构序列的药物数据集编码得到药物编码集；将所述药物编码集输入至LSTM模型中，将所述标签集输入至损失函数，所述LSTM模型训练得出训练值并输入至所述损失函数，所述损失函数计算出损失值，判断所述损失值与预设阈值的大小，直至所述损失值小于所述预设阈值时退出训练；接收用户输入的药物分子结构序列并编码后输入至所述药物损伤判断模型，输出对所述用户输入的药物分子结构序列的毒性判断。本发明还提出一种智能化药物毒性判断装置以及一种计算机可读存储介质。本发明可以实现高效的药物毒性判断。