本发明公开了一种区块链跨链合约调用方法，包括：响应区块链上的第一分片中的第一合约调用该区块链上的第二分片中的第二合约的请求，在所述第一分片中删除所述第一合约的状态树；在所述第二分片中生成所述第一合约的状态树以构建所述第一合约，并在所述第二分片中执行所述第一合约以及所述第二合约；当所述第一合约在所述第二分片中执行完毕后，在所述第二分片中删除所述第一合约的状态树；及在所述第一分片中重新生成所述第一合约的状态树以恢复所述第一合约，并在所述第一分片中继续执行所述第一合约。本发明还公开了一种区块链跨链合约调用装置及存储介质。本发明能够解决跨链合约的原子操作的问题。