一种基于高通量测序检测丛枝菌根真菌的引物及检测方法
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摘要
本发明公开了一种基于高通量测序检测丛枝菌根真菌的引物及检测方法，包括以下步骤：以待测植物或土壤样本的基因组DNA为模板，由引物一和引物二连接高通量测序通用引物接头后进行PCR扩增，PCR扩增产物纯化后进行高通量测序，将测得的原始序列经过处理得到Cleandata序列，与具有明确注释信息的丛枝菌根真菌28SrRNA参照序列相应的区域进行Blast比对，通过设置比对的相似度和覆盖率，筛选出与参照序列具有较高相似度的序列等；本方法可以灵敏地检测出土壤样本中的丛枝菌根真菌孢子和植物中的丛枝菌根真菌菌丝体，并可以使丛枝菌根真菌在属的水平上得到更好的注释，既可以进行定性分析也可以进行相对定量分析。
基本信息
专利标题 ：
一种基于高通量测序检测丛枝菌根真菌的引物及检测方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN109680091A
申请号 ：
CN201910024614.6
公开（公告）日 ：
2019-04-26
申请日 ：
2019-01-10
授权号 ：
CN109680091B
授权日 ：
2022-04-19
发明人 ：
王启刘广达
申请人 ：
内蒙古科技大学包头医学院
申请人地址 ：
内蒙古自治区包头市东河区建设路北31号
代理机构 ：
代理人 ：
优先权 ：
CN201910024614.6
主分类号 ：
C12Q1/6895
IPC分类号 ：
C12Q1/6895 C12N15/11
IPC结构图谱
C
C部——化学；冶金
C12
生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法；其所用的组合物或试纸；这种组合物的制备方法；在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验，如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6876
用于核酸分析的核酸产品，如引物或探针
C12Q1/6888
用于生物体的检测与识别
C12Q1/6895
用于植物、真菌或藻类
法律状态
2022-04-19 ：
授权
2019-05-21 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : C12Q 1/6895
申请日 : 20190110
申请日 : 20190110
2019-04-26 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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1、
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