本发明公开一种布线规则设定系统及方法，该布线规则设定系统包括：输入模块、归类模块以及处理模块。该布线规则设定方法包括以下步骤：输入要进行铺铜程序的预选区域；依据该多个子区域的属性进行归类程序；以及依据进行的归类程序的结果，将归类为该预选区域第一属性的子区域内的铜层相互连接，归类为该预选区域第二属性的子区域内的铜层则不相互连接。本发明的布线规则设定系统及方法，在设计中自动将易受干扰的元件其下方区域内的铜层与其它区域内的铜层不相连接，避免因其受干扰影响该印刷电路板的工作性能，避免需采用Cut Fill功能切割铜层的缺失，实现铜层自动相互分离，相对地提高工作效率。