本发明公开一种偏瘫神经肌肉功能治疗系统及其使用(治疗)方法。可针对患者不同病情，在偏瘫肢体神经肌肉刺激点，给予功能性电脉冲刺激，同时指示患者主动运动，使患者尽早康复。本发明其组成包括有，主计算机1、治疗信号发生器2、专用保护电路及回馈电流测量电路3、电极片针6、专用探头7以及微型打印机4和音箱5，其特征在于：主计算机控制的治疗信号发生器2经保护电路和回馈电流测量电路3输出多达200路的电刺激信号，每一路电信号输出端连接相对应的电极片针6。治疗信号发生器2，由多块信号发生板8、与主计算机通讯接口电路9以及专用电源10和探头专用信号发生器11组成；本发明主要治疗方法是主动性运动加功能性电刺激。